自从爱因斯坦逝世以后，盟军就依靠一个叫未来科技公司的集团煽动下，第三次大战又再次爆发，与此同时，“回声”也在调查这个未来科技公司，而此时，NOD还有不断壮大当中

　　当NOD将导弹射向联合国总部时，世人才发现，一个新的时代降临了，盟军与苏联也停止了他们之间在战争，全面与NOD一战，可惜的是，NOD拥有一些不明科技，加上他们有不少科技家又是从盟苏双方“跳槽”过来，两大阵营毫无招架之力，不久就全败下阵来，而那个未来科技公司也不知所踪。

　　残余的盟苏两军不得不投靠了“回声”，在收编了他们后，“回声”正式改名为GDI，并且成为了唯一与NOD对抗的组织，而这时，不隐定的局面又发生了，一个叫GLA的组织在到处破坏，而NOD也正与它发生冲突，在GDI眼中，他们都是空布分子，但是，GLA只是一群为利益的破坏分子，与NOD宣杨的理念完全不同，另外一方面，GDI也对GLA展开了打击行为，这也是两大对立阵营的第一次合作。

　　GLA瓦解后，GDI与NOD的冲突难以避免，在谣传中国加入NOD后，GDI就正式与NOD展开全面战争，后来，当GDI杀进中国时才发现，中国人正用自已落后的武器与NOD对抗，原来当初，中国的确想利用NOD对付像苏联，盟军等强大阵营，但是他们却发现自己错了，只是这已经太迟了，还好的是，GDI及时赶到，才帮助了中国人解困，但是，中国大部份都被NOD控制了，而中国人也做出了明智的选择----加入了GDI，而这时的GDI，也开始走向了完整。